Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20547B8JJN0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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