Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce3B5KM66 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms