Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrt4B2RU40 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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