Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ssxb8B1AY40 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ssxb8B1AY40 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb8B1AY40 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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