Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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