Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grik3B1AS29 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik3B1AS29 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms