Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atp8b5A3FIN4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atp8b5A3FIN4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atp8b5A3FIN4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atp8b5A3FIN4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atp8b5A3FIN4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Atp8b5A3FIN4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b5A3FIN4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Atp8b5A3FIN4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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