Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Samt1A2BED8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms