Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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