Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabreA2AMW3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabreA2AMW3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms