Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmpd1A2AKB4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms