Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34dA2AGU5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms