Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pabpc1lA2A5N3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms