Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RNP2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RNP2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RNP2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RNP2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RNP2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RNP2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RNP2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0U1RNP2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
A0A0U1RNP2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
A0A0U1RNP2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
A0A0U1RNP2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
A0A0U1RNP2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0U1RNP2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms