Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms