Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3550W4VSN7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms