Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms