Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms