Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Uso1Q9Z1Z0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms