Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccl27Q9Z1X0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccl27Q9Z1X0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccl27Q9Z1X0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl27Q9Z1X0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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