Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lgr5Q9Z1P4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms