Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slit2Q9R1B9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms