Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms