Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcamQ9R069 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms