Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms