Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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