Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms