Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms