Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer2Q9QWW1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms