Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms