Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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