Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms