Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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SrfQ9JM73 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SrfQ9JM73 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrfQ9JM73 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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