Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms