Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmod3Q9JHJ0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Tmod3Q9JHJ0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Tmod3Q9JHJ0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Tmod3Q9JHJ0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tmod3Q9JHJ0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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