Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp29Q9ES63 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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