Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnft1Q9DCN7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms