Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms