Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms