Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms