Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms