Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smco2Q9DA21 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms