Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Subh2bvQ9D9Z7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Subh2bvQ9D9Z7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Subh2bvQ9D9Z7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Subh2bvQ9D9Z7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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