Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cnot8Q9D8X5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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