Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D8N1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms