Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4bQ9D8B3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4bQ9D8B3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4bQ9D8B3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4bQ9D8B3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4bQ9D8B3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4bQ9D8B3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4bQ9D8B3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chmp4bQ9D8B3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms