Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms