Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9D7E4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9D7E4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms