Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop56Q9D6Z1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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