Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms